Virus Respiratorio Sincitial (VRS) para BOINC
NOTE
This project is finished. There will be no need of more distributed computations in the near future.
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There were several conclusions extracted from the study of the VRS model. To sum up: First, that it is in fact possible to use a network model to simulate quite good the infection scheme and that the network model fits better than the usual continous model. Second, that once the model is defined, it is possible to figure out what would happend under certain vaccination schedules, and provide a picture of the cost and benefit of each schedule. And three and more shocking (in fact this goes against the general understanding of the disease, and is quite polemic) that the periodic prevalence of the disease is not linked (or at least could be not linked) to a seasonality periodicity but it arrises naturally from the particular way the virus infects people.
- Paper “Random Networks in a Distributed Computing Environment: An Approach to the Transmission Dynamics of Epidemic Diseases” in the Proceedings of the Seventh International Conference on Engineering Computational Technology (doi: 10.4203/ccp.94.25)
- Paper “Seasonal Respiratory Syncytial Virus Epidemic in a Random Social Network”, in the Modelling for addictive behaviour, medicine and engineering 2010
- Paper “Random networks to study the dynamics of respiratory syncitial virus (RSV) in the Spanish region of Valencia”, in the Mathematical and Computer Modelling (doi:10.1016/j.mcm.2010.11.068)
Findings have been provided in the following publications
NOTA
Este proyecto ha terminado. No habrá necesidad de más cálculos distribuidos en el futuro próximo.
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Hay varias conclusiones a las que se ha llegado tras el estudio del modelo del VRS. Resumiendo mucho: primero, que de hecho es posible usar un modelo de redes aleatorias para simular bastante bien el patrón infeccioso y que dicho modelo de red ajusta mejor que los modelos continuos convencionales. Segundo, que una vez se ha definido el modelo, éste se puede usar para prever qué ocurriría bajo ciertas políticas de vacunación, y proporcionar una idea de la relación coste/beneficio de la misma. Y tercero, y más impactante, (de hecho esto va en contra de lo comúnmente aceptado y es bastante polémico) que la prevalencia de la enfermedad no está relacionado (o al menos podría no estar relacionado) con una periodicidad estacional, sino que surge de manera natural por las características infeccionas de la enfermedad.
- Artículo “Random Networks in a Distributed Computing Environment: An Approach to the Transmission Dynamics of Epidemic Diseases” en el Proceedings of the Seventh International Conference on Engineering Computational Technology (doi: 10.4203/ccp.94.25)
- Artículo “Seasonal Respiratory Syncytial Virus Epidemic in a Random Social Network”, en el Modelling for addictive behaviour, medicine and engineering 2010
- “Random networks to study the dynamics of respiratory syncitial virus (RSV) in the Spanish region of Valencia”, en el Mathematical and Computer Modelling (doi:10.1016/j.mcm.2010.11.068)
Los análisis y hallazgos derivados del estudio del VRS se han comunicado en las siguientes publicaciones:
Informe detallado del proyecto (en español) 
Detailed Project Report (in English) 
Szczegółowe sprawozdanie projektu (w języku polskim) 
Report del progetto VRS (en italiano) 
Enlace del proyecto / Project Link / Projekt-Link
http://falua.cesfelipesegundo.com/VRS/
http://falua.cesfelipesegundo.com/VRS/forum_index.php
http://falua.cesfelipesegundo.com/VRS/server_status.php
Estadísticas / Statistics / Statistik
http://boincstats.com/index.php?pr=vrs
http://www.estadisticasboinc.es
http://stats.free-dc.org/stats.php?page=proj&proj=vrs
Algunos datos técnicos / some technical data / ein paar technische Daten:
Unidades de trabajo / Work Units / Arbeitseinheiten FASE III (OVER):
40.000
Tiempo medio de cálculo por unidad / Average computation time per Work Unit / Durchschnittliche Zeit pro Einheit berechnet:
+/- 80 minutos / minutes / Minuten
Tiempo de cálculo total requerido con un solo ordenador / Total computation time required for a single computer / Total Rechenzeit mit einem einzelnen Computer erforderlich:
+/- 6 años / years / Jahre
Unidades de trabajo / Work Units / Arbeitseinheiten FASE II (OVER):
140.000
Tiempo medio de cálculo por unidad / Average computation time per Work Unit / Durchschnittliche Zeit pro Einheit berechnet:
+/- 80 minutos / minutes / Minuten
Tiempo de cálculo total requerido con un solo ordenador / Total computation time required for a single computer / Total Rechenzeit mit einem einzelnen Computer erforderlich:
+/- 21 años / years / Jahre
Unidades de trabajo / Work Units / Arbeitseinheiten FASE I (OVER):
60.000
Tiempo medio de cálculo por unidad / Average computation time per Work Unit / Durchschnittliche Zeit pro Einheit berechnet:
+/- 25 minutos / minutes / Minuten
Tiempo de cálculo total requerido con un solo ordenador / Total computation time required for a single computer / Total Rechenzeit mit einem einzelnen Computer erforderlich:
+/- 3 años / years / Jahre
Estado de los cálculos / Computation status / Berechnung Status
Tiempo de CPU / CPU Time / CPU Zeit FASE III (OVER):
+/- 13000 Horas / Hours / Stunden
Unidades de Trabajo procesadas / Work Units processed / Verarbeitet Arbeitseinheiten:
+/- 40000
Unidades restantes / Remaining Work Units / Restlichen Arbeitseinheiten:
+/- 0
Tiempo de CPU / CPU Time / CPU Zeit FASE II (OVER):
+/- 186000 Horas / Hours / Stunden
Unidades de Trabajo procesadas / Work Units processed / Verarbeitet Arbeitseinheiten:
+/- 140000
Unidades restantes / Remaining Work Units / Restlichen Arbeitseinheiten:
0
VRS (de Virus Respiratorio Sincitial) es un proyecto BOINC que tiene como objetivo modelar el comportamiento del virus respiratorio sincitial. La motivación principal es que:
• Es la principal causa de infecciones en el tracto respiratorio inferior y de las hospitalizaciones durante la infancia y juventud.
• En España causa más de 15.000 visitas al pediatra cada año.
• Es responsable de más del 18% de las hospitalizaciones por neumonía en ancianos.
• En EEUU se infectan más del 60% de los recién nacidos durante su primera temporada ante el VRS. Para cuando el niño tenga 2 o 3 años con casi total seguridad habrá sido infectado por el VRS. De todos estos niños infectados, el 23% desarrollará bronquiolitis y tendrá que ser hospitalizado.
Nuestro proyecto de simulación de los mecanismos de contagio del VRS nos permitirá:
• Entender mejor la evolución del contagio y sus parámetros más relevantes.
• Predicciones más rápidas de la evolución del virus.
• Diseño de campañas de vacunación más precisas.
VRS (from the Spanish Virus Respiratorio Sincitial) is a BOINC-based project which main aim is to simulate the behaviour of the human Respiratory Syncytial Virus (RSV). Main facts:
• It is the major cause of lower respiratory tract infection and hospital visits during infancy and childhood.
• In Spain, it causes more than 15.000 padiatrician visits per year.
• It is responsible for more than 18% of the pneumonia elderly hospitalizations.
• In the United States, 60% of infants are infected during their first RSV season. Nearly all children will have been infected with the virus by 2-3 years of age. Of those infected with RSV, 23% will develop bronchiolitis necessitating hospitalization.
Our project simulations of the RSV contagion mechanisms will allow:
• Better understanding of the contagion evolution and its relevant parameters.
• Faster predictions of the virus population evolution.
• Designing more accurate vaccination campaigns.
VRS (von Virus Respiratorio Sincitial) ist ein BOINC Projekt, welches es sich zur Aufgabe gemacht hat, das Verhalten des respiratorischen Synzitial-Virus zu modellieren. Die Hauptbeweggründe hierfür sind:
• Es ist Hauptursache von Infektionen der unteren Atemwege und stationären Behandlungen von Kindern und Jugendlichen.
• In Spanien ist es der Grund für mehr als 15.000 Besuche beim Kinderarzt jedes Jahr.
• Es ist für mehr als 18% der stationären Behandlungen aufgrund von Lungenentzündung bei Senioren verantwortlich.
• In den Vereinigten Staaten infizieren sich mehr als 60% der Neugeborenen während der ersten Lebensmonate mit RSV. Im Alter von zwei oder drei Jahren ist jedes Kind mit fast absoluter Sicherheit mit RSV infiziert worden. Von all den infizierten Kindern entwickeln 23% eine Bronchiolitis, welche eine stationäre Behandlung nach sich zieht.
Unser Projekt zur Simulation der Ansteckungsmechanismen mit RSV eröffnet uns folgende Möglichkeiten:
• Ein besseres Verständnis für den Prozess der Ansteckung und der dabei wichtigsten Parameter.
• Schnellere Vorhersagen über die Entwicklung des Virus.
• Die Ausarbeitung präziserer Impfkampagnen.
VRS (à partir de l’espagnol syncytiale Virus respiratorio) est un projet BOINC qui objectif principal est de simuler le comportement de l’homme face au virus respiratoire syncytial (VRS). Principaux faits:
• Il est la principale cause d’infection des voies respiratoires inférieures et visites à l’hôpital durant l’enfance.
• En Espagne, elle cause plus de 15.000 visites padiatrician par an.
• Il est responsable de plus de 18% de la pneumonie hospitalisations des personnes âgées.
• Aux Etats-Unis, 60% des nourrissons sont infectés par le VRS pendant leur première saison. Presque tous les enfants ont été infectés par le virus de 2-3 ans. Parmi les personnes infectées par le VRS, 23% développeront une bronchiolite nécessitant une hospitalisation.
Nos projets de simulation des mécanismes de contagion VRS permettra:
• Une meilleure compréhension de l’évolution de contagion et de ses paramètres pertinents.
• Prévisions plus rapide de l’évolution de la population du virus.
• Conception des campagnes de vaccination plus précis.
Virus Respiratorio Sincitial lub VRS – To projekt oparty o architekturę BOINC którego głównym celem jest symulacja zachowania wirusa RSV. Główne fakty
• Jest główną przyczyną infekcji dolnych dróg oddechowych i hospitalizacji podczas dzieciństwa i niemowlęctwa.
• W Hiszpanii jest przyczyną 15000 wizyt pediatrycznych w ciągu roku
• Jest odpowiedzialny za ponad 18% przypadków hospitalizacji spowodowanych zapaleniem płuc u osób starszych.
• W Stanach Zjednoczonych 60% niemowląt zostaje zarażonych podczas pierwszego sezonu zachorowań na RSV. Prawie wszystkie dzieci przejdą infekcje nim skończą 2-3 rok zycia. Spośród tych zainfekowanych wirusem RSV, u 23% rozwinie się ostre zapalenie oskrzelików wymagające hospitalizacji
Nasz projekt poprzez symulację mechanizmów infekcji pozwoli na:
• lepsze rozumienie rozwoju infekcji i jej znaczących parametrów
• szybsze przewidywanie rozwoju populacji wirusa
• zaprojektowanie lepszych kampanii szczepień
VRS(dallo spagnolo Virus Respiratorio Sincitial) è un progetto BOINC il cui scopo principale è quello di simulare il comportamento del virus umano Respiratory Syncytial Virus. Alcune notizie sul virus:
• è una delle maggiori cause delle infezioni all’apparato respiratorio inferiore e una delle maggiori motivazioni delle visite in ospedale durante i primi anni di vita dei bambini.
• in Spagna causa più di 15.000 visite pediatriche all’anno.
• è responsabile di più del 18% dei ricoveri ospedalieri per polmonite tra gli anziani.
• negli Sati Uniti il 60% dei bambini vengono infettati durante il primo periodo in cui vengono esposti al virus RSV. Praticamente il 100% dei bambini vengono infettati nei primi 2-3 anni di età. Di questi, almeno il 23% sviluppa delle bronchiti che necessitano di ricovero.
Le nostre simulazioni del meccanismo di contagio da RSV permetteranno:
• una migliore comprensione dell’evoluzione del contagio e dei suoi parametri significativi.
• previsioni più celeri sulla evoluzione del virus nella popolazione.
• progettazione di campagne di vaccinazione più efficaci e accurate.
Puede contactar con el investigador a cargo para información adicional / You can reach the researcher in charge for additional information / Sie können die verantwortlichen Versuchsleiter für weitere Informaionen kontaktieren / Możecie się skontaktować z Naukowcem prowadzącym by uzyskać dalsze informacje:
Doctor Javier Villanueva
Email jvillanueva AT pdi DOT ucm DOT es
Teléfono +34 91 809 92 00 extension / wewnętrzny 210
Universidad Complutense de Madrid – CES Felipe II
Aranjuez – Madrid – España
En colaboración con:
Instituto de Matemática Multidisciplinar – Universidad Politécnica de Valencia
Valencia – España
Foros que apoyan el proyecto / Forums supporting this project / Foren Unterstützung dieses Projekts:
AMDUSERS.COM
http://amdusers.com/forum/showthread.php?6391-Virus-Respiratorio-Sincitial-%28new-BOINC-project%29
BC-TEAM.ORG
http://www.bc-team.org/viewtopic.php?t=568
CANALBOINC.COM
http://www.canalboinc.com/modules/newbb/viewtopic.php?viewmode=flat&type=&topic_id=42265&forum=223
http://vrs.canalboinc.com
http://vrs.canalboinc.es
TITANESDC.COM
http://www.titanesdc.com/foros/proyectos-nuevos/5670-virus-respiratorio-sincitial-vrs.html
UKBOINCTEAM.COM
http://forum.ukboincteam.com/viewtopic.php?p=57587&sid=ce2e90dba7c7f1c63b30832fb7dc24c9
BOINC-AF.ORG
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3598.0.html
BOINCEDLS
http://www.boincedls.org/forum/viewtopic.php?pid=10238 (Merci Viny pour cette traduction)
BOINC-TEAM.DE
http://www.boinc-team.de/portal/showtopic.php?threadid=1635&pagenum=lastpage
BOINCATPOLAND.ORG
http://www.boincatpoland.org/smf/ostatnio-znalezione/virus-respiratorio-sincitial/
BOINCITALY.ORG
http://www.boincitaly.org/index.php?option=com_fireboard&Itemid=2&func=view&id=53969&catid=20
TEAM-NINJA.COM
http://www.team-ninja.com/vbulletin/showthread.php?p=361440
RECHENKRAFT.NET
http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=Virus_Respiratorio_Sincitial
A todos los que nos ayudan / To everyone helping us / Um alle helfen uns
¡Gracias! / Thank You! / Danke!
Gracias a
Aleksander Parkitny por su traducción al polaco
Viny por su traducción al francés
baxnimis por su traducción al italiano